A vírgula em e sim, e não

 Antes de e sim se usa a vírgula?

Certamente. A expressão e sim, que introduz uma ideia contrária, uma correção da anterior, deve ser precedida de vírgula. Entretanto, não se deve isolar o sim com vírgulas. Use somente uma, antes do e sim. A regra também vale para e não e mas sim. Exemplos:

– Ele não fez as tarefas de que foi incumbido, e sim as que ele quis;

– Ela quis agradar-me, e não ofender-me.

Em se tratando de mas sim, pode-se isolar o sim com vírgulas:

– Ele não fez as tarefas de que foi incumbido, mas sim as que ele quis.

– Ele não fez as tarefas de que foi incumbido, mas, sim, as que ele quis.

Quer saber por que o sim, nesse caso, pode ser isolado? É porque o mas por si só já tem valor adversativo (que introduz ideias contrárias). Por isso, o sim pode funcionar como mero reforço, equivalendo a isso sim.

– Ele não fez as tarefas de que foi incumbido, mas, isso sim, as que ele quis.